jueves, 26 de diciembre de 2013

Metabolismo microbiano

Cuando vemos como crece una persona desde que es un niño hasta que es un adulto entendemos que comer todos los días ayuda a ese crecimiento. Pero no entendemos que sucede con el alimento al comerlo. Los médicos dice que “metabolizamos” los alimentos. Los microorganismos haces algo muy similar. Por lo tanto debemos definir la palabra metabolismo.

Metabolismo
El metabolismo es el método bioquímico para obtener energía a través de degradar moléculas complejas a moléculas simples. Decimos que es un método bioquímico porque intervienen características químicas (enlaces entre las moléculas, reacciones enzimáticas) y biológicas (la utilización de moléculas orgánicas y el sistema biológico que engloba el proceso).
Cuando hablamos de metabolismo básico podemos mencionar algunos procesos fundamentales en la biología.

La glucólisis

La glucólisis es el proceso mediante el cual se degrada una molécula de azúcar hasta otra molécula llamada piruvato (o ácido pirúvico). Este proceso es común en todos los caminos metabólicos que impliquen la utilización de un compuesto carbonado como fuente de energía. Es muy común que, a modo de ejemplo, se utilice una molécula de glucosa como azúcar. Dado que la glucosa es una molécula de 6 carbonos cada glucosa producirá 2 moléculas de piruvato, el cual posee 3 carbonos. En casos donde la molécula de azúcar no tiene 6 carbonos es muy posible o bien obtener dióxido de carbono como deshecho o bien que el esqueleto de carbono que no se modifique a piruvato pase a oros ciclos celulares en los que obtendrá más carbono para reingresar a la glucólisis (por ejemplo el ciclo de las pentosas).

El ciclo de Krebs o Calvin-Benson o ciclo de los ácidos tricarboxílicos
El Ciclo de Krebs, o también conocido como ciclo de Calvin-Benson, es una fase de obtención de potencial electrónico que luego seguirá en el proceso de la fosforilación oxidativa. Todo este proceso requiere de la presencia de oxígeno, el cual funcionará como aceptor de electrones. Para comenzar el ciclo partimos desde la molecula de piruvaro (3C) y le quitamos un carbono mientras le agregamos un grupo llamado CoA (coenzima A). De esta manera obtenemos una molécula que se llama Acetil CoA. Esta molécula se unirá al oxalacetato para producir ácido cítrico. Este compuesto sufrirá una serie de pérdidas de carbono hasta volver a transformarse en oxalacetato para nuevamente unirse a una molécula de acetil CoA. Como ven allí se forma el ciclo.

Esquema de respiración aeróbica
La fermentación
La fermentación es un proceso en el cual, en ausencia de oxígeno o en condiciones en las cuales el oxígeno no será utilizado como aceptor de electrones, se utiliza una molécula orgánica en cambio para obtener energía. Dado que luego de la glucólisis se producen 2 moléculas de piruvato, el metabolismo utilizará esta molécula para generar una diversidad de productos que le den algo de energía adicional. Algunos de estos productos de fermentación son muy conocidos por su aplicación general (por ejemplo el alcohol, el ácido láctico y el ácido acético típicos de las bebidas alcohólicas, el yogur y el vinagre respectivamente). Otros tipos de fermentación, como la del ácido propiónico, el 2,3-butanodiol, el butanol y el isopropanol, son poco conocidas por el público, aunque son muy conocidas por la industria de las fermentaciones.

Algunas fermentaciones de interés
Fermentación alcohólica
En la fermentación alcohólica el azúcar es degradado hasta formar etanol y dióxido de carbono como producto de deshecho. El dióxido de carbono, al ser un gas, es eliminado en forma de burbujas mientras que el alcohol se disuelve en el agua dando origen así a la bebida alcohólica.
La fermentación alcohólica es llevada a cabo por la levadura Saccharomyces cerevisiae, con la cual obtenemos productos como el vino, la cerveza y el pan. En la fermentación esta levadura es capaz de alcanzar valores tan altos como 20°de alcohol. El alcohol producido por la levadura funciona como inhibidor de otros microorganismos, pero a cierta graduación también inhibirá a la levadura volviendo muy lenta la fermentación.
Las bebidas obtenidas de la fermentación alcohólica pueden ser no destiladas (vino, cerveza, sake, sidra) o destiladas (whisky, ginebra, vodka). La diferencia consiste en que en las bebidas destiladas, luego de la fermentación se hace una destilación fraccionada para aumentar el volumen de alcohol.


Fermentación láctica (ácido láctica)
En la fermentación ácido láctica el piruvato es transformado a ácido láctico. Este ácido es incoloro y líquido (apenas más denso que el agua). El ácido láctico al ser un ácido baja el pH de la solución rápidamente pero no llega a valores de acidez menores que 2,5. El ácido láctico es producido por algunas células del cuerpo (las células musculares) y por las bacterias del género Lactobacillus. Particularmente Lactobacillus bulgaricus es una excelente productora de ácido láctico y se encuentra presente en la fermentación de la leche para producir yogur. Esta bacteria es anaerobia facultativa; esto quiere decir que, a pesar de estar en presencia de oxígeno prefiere fermentar el azúcar. Esta bacteria se ha especializado en la glucólisis de la lactosa, el azúcar típico de la leche. Pero además de esto requiere una temperatura de entre 40 y 45 °C para metabolizar.

La fermentación acética (ácido-acética)
Otra fermentación importante llevada a cabo por bacterias el la fermentación ácido-acética. En esta fermentación las bacterias como Acetobacter aceti utilizan el piruvato para producir ácido acético. Lo interesante de estas bacterias es que son tolerantes a la presencia de alcohol, por lo que pueden fermentar otros azúcares que las levaduras no fermentaron. Para el caso particular de los vinos, la fermentación ácido acética resulta en un riesgo por la posibilidad de la pérdida del producto final (el vino). Pero también puede ser un paso necesario para la producción de vinagre de vino.



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